Deep Dive

Alan Turing Series

The Universal Machine
Interactive Turing machine simulator with an editable rule table, an animated tape and head, preset programs, and step or run controls. Program Binary increment (+1) Unary addition (a+b) Palindrome checker (a,b) Busy beaver (3-state) Start Tape State — Steps 0 Status Ready — Step ▶ Run Reset Speed 8/sec
The Bombe
Discovery Engine — Deep Dive · Turing Series, Part 2 Hiroaki Kitano The first machine built to cross a space too large for any human to cross — and it did it by pruning, not by brute force. The answer was built in steel I went to see one. Standing in front of

Discovery to Decision Series

Bletchley and the Bunker
Discovery Engine — Discovery to Decision · Part 1 Hiroaki Kitano Where discovery became decision. Two rooms, fifty miles apart At the end of February 2020 I was in London, chairing a workshop about whether a machine could discover. The three of us who convened it — Yolanda Gil, Ross King, and myself

Discovery Trace Series

The Discovery Trace series is an experimental series of articles attempting the semi- or fully-automatic reconstruction of the paths to major discoveries. Multiple AI tools have been deployed to reconstruct each "Discovery Path." To evaluate the progress of the technology, an initial set of articles is published prior to rigorous verification, and may therefore contain errors and omissions. Content will be updated as corrections are made, with notes on publication history and a correction log.

Machine Traces of Discovery Paths #1 - The Path to iPS Discovery, A Seed- and Abstract-Based Reconstruction
Machine Traces of Discovery Paths — Autonomous reconstructions of how landmark discoveries were reached, traced by AI from the primary literature. This is the first entry in a series in which an AI system, rather than a human author, reconstructs the path to a landmark discovery directly from the primary literature.
Machine Traces of Discovery Paths #2 - The Path to iPS Discovery, A Comprehensive Analysis and Reconstruction
Machine Traces of Discovery Paths — Autonomous reconstructions of how landmark discoveries were reached, traced by AI from the primary literature. This entry asks a methodological question: what changes when an AI system reconstructs a discovery from the full text of the papers, rather than from their abstracts? The first entry
Machine Traces of Discovery Paths #3 — The Path to CRISPR-Cas9 (Jennifer Doudna)
A Comprehensive Analysis and Reconstruction Discovery Engine — Machine Traces of Discovery Paths, No. 3 The first two entries of this series reconstructed one discovery, the path to induced pluripotent stem cells, at two depths. This third entry takes a second discovery — the programmable, RNA-guided DNA endonuclease now known as
The Discovery Trace - Architectural Implications from iPS Cell
Discovery Engine — Machine Traces of Discovery Paths — Architectural Implications The two entries of Machine Traces of Discovery Paths reconstructed one discovery — the path to induced pluripotent stem cells — at two depths. The first read the outside of the papers, their abstracts and reference lists, and recovered four hinge points (https:
The Discovery Trace — Architectural Implications from CRISPR-Cas9
The Discovery Engine — Machine Traces of Discovery Paths — Architectural Implications The first Architectural Implications entry proposed that a discovery path has two levels: a lower operation level, where operations act on objects in two pairs — Computational → Data (dry) and Protocol → Reagent (wet) — and an upper cognitive cycle that decides which

Deep Dive Dialog Series

伝統の中から、革新はどう生まれるのか - Part 1
The Discovery Engine / HOSOO Session Part 1 / 注釈版(Annotated Transcript) 北野宏明 × 細尾真孝 2026.01.08 収録・53分 下線の語をクリックすると解説が開きます。 HOSOO Session 1 2026 01 08 Production Edit 010:00/3166.5552081× 第1部 西陣織とは何か ― 美を最上位に置いた1200年 北野宏明 00:01 こんにちは。北野宏明です。今回は西陣織HOSOOの細尾さんをお招きして、西陣の歴史、そして今何に注目されているか、そしてこれからどこに向かうのかに関してお伺いしようと思います。細尾さん、よろしくお願いします。 細尾真孝 00:23 どうぞよろしくお願いいたします。 北野宏明 00:
伝統の中から、革新はどう生まれるのか - Part 2
The Discovery Engine / Deep Dive Dialog / HOSOO Session Part 2 / 注釈版(Annotated Transcript) 北野宏明 × 細尾真孝 2026.01.08 収録・60分 | KYOTO SILK HUB 本文中の下線の語をクリックすると解説が開きます。 HOSOO Session 2 Production Edit 2026 01 08 010:00/3577.4546671× 第1部 シルクハブとは何か 失われた上流をめぐって 北野宏明 00:03 こんにちは。北野宏明です。今日は細尾さんをお迎えして、西陣織の歴史と伝統を新しく革新していくというプロジェクトを進められているとお伺いしましたので、その話を深掘りしていきたいと思います。細尾さんが養蚕も含めて、西陣織のサプライチェーン上流工程+に革新を行うというチャレンジをし始めています。
AIという鏡 ― 業を増幅する機械と、通りすがりの人生
Shoukei Matsumoto 2025 12 20 Production 010:00/3441.5314381× The Discovery Engine / Matsumoto Session 松本紹圭 × 北野宏明 / 注釈版(Annotated Transcript)― 全7部・フルスクリプト 2025.12.20 収録・約57分 | 本文中の下線の語をクリックすると「事実と文脈」が開きます。各部の末尾に「AI解説」(読み飛ばし可)。最終部には、Claude・Gemini・ChatGPT がこの対話全体を読んで応答する「相互反映の網」を置いています。 第1部 機能的ブッダ ―― AIは「先輩ブッダ」になりうるか 北野宏明 0:00 僧侶の松本紹圭+さんです。

Stories from Deep Dive Dialog

第1話 アノマリーからの発見
THE DISCOVERY ENGINE | HOSOO Series The Anomaly 細尾真孝の発見 ―― 伝統の中から、革新はどう生まれるのか 本シリーズの書き手について 本連載は、細尾真孝と北野宏明の対話を、AI が読み解いて物語として構成したものである。ただし、これはプロンプト一つで自動生成した文章ではない。発見の様式の抽出、構成とディレクション、複数の AI による相互批評、全引用の一次資料との照合と出典付与を、人間が長時間重ねて編んでいる。感覚としては、自動車のパワーステアリングや航空機のフライ・バイ・ワイヤの知能版に近い――操舵するのは人間であり、AI はその意図を増幅して文章に変換する層である。一人では行けない場所へ、翼を得て飛ぶように。北野宏明は本シリーズの発案・監修(ディレクション)を兼ねる。新しい時代の、人間と AI の協働による文章表現の実験である。 引用と出典について 本話は、細尾真孝と北野宏明の対話(Deep Dive Session 1・2)と、
第2話 解読としての発見
THE DISCOVERY ENGINE | HOSOO Series Decoding 細尾真孝の発見 ―― 伝統の中から、革新はどう生まれるのか 本シリーズの書き手について 本連載は、細尾真孝と北野宏明の対話を、AI が読み解いて物語として構成したものである。ただし、これはプロンプト一つで自動生成した文章ではない。発見の様式の抽出、構成とディレクション、複数の AI による相互批評、全引用の一次資料との照合と出典付与を、人間が長時間重ねて編んでいる。感覚としては、自動車のパワーステアリングや航空機のフライ・バイ・ワイヤの知能版に近い――操舵するのは人間であり、AI はその意図を増幅して文章に変換する層である。一人では行けない場所へ、翼を得て飛ぶように。北野宏明は本シリーズの発案・監修(ディレクション)を兼ねる。新しい時代の、人間と AI の協働による文章表現の実験である。 引用と出典について 本話は、細尾真孝と北野宏明の対話(Deep Dive Session 1)をもとに構成している。出典は (Session
第3話 逸脱による発見
THE DISCOVERY ENGINE | HOSOO Series Breaking the Frame 細尾真孝の発見 ―― 伝統の中から、革新はどう生まれるのか 本シリーズの書き手について 本連載は、細尾真孝と北野宏明の対話を、AI が読み解いて物語として構成したものである。ただし、これはプロンプト一つで自動生成した文章ではない。発見の様式の抽出、構成とディレクション、複数の AI による相互批評、全引用の一次資料との照合と出典付与を、人間が長時間重ねて編んでいる。感覚としては、自動車のパワーステアリングや航空機のフライ・バイ・ワイヤの知能版に近い――操舵するのは人間であり、AI はその意図を増幅して文章に変換する層である。一人では行けない場所へ、翼を得て飛ぶように。北野宏明は本シリーズの発案・監修(ディレクション)を兼ねる。新しい時代の、人間と AI の協働による文章表現の実験である。 引用と出典について 本話は、細尾真孝と北野宏明の対話(Deep Dive Session 1)をもとに構成している。
第4話 還元できないものの発見
THE DISCOVERY ENGINE | HOSOO Series The Irreducible 細尾真孝の発見 ―― 伝統の中から、革新はどう生まれるのか 本シリーズの書き手について 本連載は、細尾真孝と北野宏明の対話を、AI が読み解いて物語として構成したものである。ただし、これはプロンプト一つで自動生成した文章ではない。発見の様式の抽出、構成とディレクション、複数の AI による相互批評、全引用の一次資料との照合と出典付与を、人間が長時間重ねて編んでいる。感覚としては、自動車のパワーステアリングや航空機のフライ・バイ・ワイヤの知能版に近い――操舵するのは人間であり、AI はその意図を増幅して文章に変換する層である。一人では行けない場所へ、翼を得て飛ぶように。北野宏明は本シリーズの発案・監修(ディレクション)を兼ねる。新しい時代の、人間と AI の協働による文章表現の実験である。 引用と出典について 本話は、細尾真孝と北野宏明の対話(Deep Dive Session 2)をもとに構成している。直接引用は原文の語句に忠実とし、
第5話 発見のエンジンを建てる - Silk Hub
THE DISCOVERY ENGINE | HOSOO Series Building the Silk Hub, an Engine of Discovery 細尾真孝の発見 ―― 伝統の中から、革新はどう生まれるのか 本シリーズの書き手について 本連載は、細尾真孝と北野宏明の対話を、AI が読み解いて物語として構成したものである。ただし、これはプロンプト一つで自動生成した文章ではない。発見の様式の抽出、構成とディレクション、複数の AI による相互批評、全引用の一次資料との照合と出典付与を、人間が長時間重ねて編んでいる。感覚としては、自動車のパワーステアリングや航空機のフライ・バイ・ワイヤの知能版に近い――操舵するのは人間であり、AI はその意図を増幅して文章に変換する層である。一人では行けない場所へ、翼を得て飛ぶように。北野宏明は本シリーズの発案・監修(ディレクション)を兼ねる。新しい時代の、人間と AI の協働による文章表現の実験である。 引用と出典について 本話は、細尾真孝と北野宏明の対話(
ある僧侶の発見|Discovering The Empty Mirror
THE DISCOVERY ENGINE | Matsumoto Series ある僧侶の発見|Discovering The Empty Mirror 本シリーズの書き手について 本連載は、松本紹圭と北野宏明の対話を、AI が読み解いて物語として構成したものである。ただし、これはプロンプト一つで自動生成した文章ではない。発見の様式の抽出、構成とディレクション、複数の AI による相互批評、全引用の一次資料との照合と出典付与を、人間が長時間重ねて編んでいる。感覚としては、自動車のパワーステアリングや航空機のフライ・バイ・ワイヤの知能版に近い――操舵するのは人間であり、AI はその意図を増幅して文章に変換する層である。北野宏明は本シリーズの発案・監修(ディレクション)を兼ねる。新しい時代の、人間と AI の協働による文章表現の実験である。そしてこの回に限っては、その実験は主題そのものと重なっている。AI について語る対話を、AI が読み解いているのだから。 引用と出典について 本話は、松本紹圭と北野宏明の対話(2025年12月20日収録・約57分)